Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI67

KRTAP6-3, Keratin-associated protein 6-3, humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP6-3Q3LI67 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP6-3Q3LI67 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP6-3Q3LI67 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP6-3Q3LI67 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP6-3Q3LI67 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP6-3Q3LI67 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP6-3Q3LI67 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP6-3Q3LI67 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP6-3Q3LI67 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP6-3Q3LI67 MED11-201ENST00000293777 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP6-3Q3LI67 KLK8-203ENST00000347619 555 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP6-3Q3LI67 TAC4-203ENST00000352793 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP6-3Q3LI67 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP6-3Q3LI67 RNASE11-201ENST00000398008 872 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP6-3Q3LI67 AIMP2-203ENST00000400479 1107 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP6-3Q3LI67 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP6-3Q3LI67 AL391839.2-201ENST00000412085 383 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP6-3Q3LI67 MESTP4-201ENST00000412333 1204 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP6-3Q3LI67 SLC5A4-AS1-201ENST00000434942 876 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP6-3Q3LI67 AL138902.1-201ENST00000437965 856 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP6-3Q3LI67 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP6-3Q3LI67 SRP9P1-201ENST00000445874 261 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP6-3Q3LI67 NALT1-202ENST00000450304 437 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP6-3Q3LI67 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP6-3Q3LI67 AL358115.1-202ENST00000455257 675 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP6-3Q3LI67 RN7SL684P-201ENST00000465665 294 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP6-3Q3LI67 AC108474.1-201ENST00000507776 421 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP6-3Q3LI67 MRNIP-216ENST00000521333 410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP6-3Q3LI67 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP6-3Q3LI67 AL161668.2-201ENST00000531638 492 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP6-3Q3LI67 ZNF816-208ENST00000535506 529 ntTSL 4 BASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP6-3Q3LI67 C12orf57-204ENST00000540506 551 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP6-3Q3LI67 FAM60A-207ENST00000542983 738 ntTSL 4 BASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP6-3Q3LI67 ADIPOR1P2-201ENST00000554199 820 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP6-3Q3LI67 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP6-3Q3LI67 TNNI1-205ENST00000555948 580 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP6-3Q3LI67 KRT8P2-201ENST00000556193 944 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP6-3Q3LI67 AL352977.2-201ENST00000557101 547 ntTSL 4 BASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP6-3Q3LI67 SPATA8-202ENST00000558553 406 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP6-3Q3LI67 AC005096.1-201ENST00000560499 622 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP6-3Q3LI67 AC091489.1-201ENST00000563866 691 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP6-3Q3LI67 TTC39A-AS1-201ENST00000564479 812 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP6-3Q3LI67 AC109460.2-202ENST00000568057 573 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP6-3Q3LI67 AC010601.1-201ENST00000569048 446 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP6-3Q3LI67 NT5C-204ENST00000578337 582 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP6-3Q3LI67 MYL12A-206ENST00000578611 1004 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP6-3Q3LI67 ZNF286A-212ENST00000580259 527 ntTSL 4 BASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP6-3Q3LI67 SNHG15-209ENST00000584686 541 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP6-3Q3LI67 AC010319.2-201ENST00000594663 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP6-3Q3LI67 ZNF724-202ENST00000597037 780 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP6-3Q3LI67 AC010127.1-202ENST00000597623 713 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP6-3Q3LI67 AL136982.5-201ENST00000605222 294 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP6-3Q3LI67 AL359091.4-201ENST00000610052 409 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP6-3Q3LI67 SNX20-205ENST00000610485 557 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP6-3Q3LI67 Metazoa_SRP.180-201ENST00000612546 322 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP6-3Q3LI67 SDHD-214ENST00000614349 516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP6-3Q3LI67 Metazoa_SRP.144-201ENST00000617007 311 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP6-3Q3LI67 Metazoa_SRP.168-201ENST00000621608 264 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP6-3Q3LI67 AC024580.2-201ENST00000623363 231 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP6-3Q3LI67 LINC01615-203ENST00000634877 673 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP6-3Q3LI67 CDIPT-AS1-203ENST00000638164 713 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP6-3Q3LI67 AC138627.1-201ENST00000641127 1257 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP6-3Q3LI67 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP6-3Q3LI67 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP6-3Q3LI67 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP6-3Q3LI67 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP6-3Q3LI67 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP6-3Q3LI67 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP6-3Q3LI67 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP6-3Q3LI67 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP6-3Q3LI67 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP6-3Q3LI67 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP6-3Q3LI67 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP6-3Q3LI67 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP6-3Q3LI67 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP6-3Q3LI67 WRB-202ENST00000380708 1464 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP6-3Q3LI67 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP6-3Q3LI67 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP6-3Q3LI67 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP6-3Q3LI67 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP6-3Q3LI67 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP6-3Q3LI67 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP6-3Q3LI67 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP6-3Q3LI67 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP6-3Q3LI67 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP6-3Q3LI67 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP6-3Q3LI67 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP6-3Q3LI67 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP6-3Q3LI67 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP6-3Q3LI67 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP6-3Q3LI67 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP6-3Q3LI67 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP6-3Q3LI67 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP6-3Q3LI67 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP6-3Q3LI67 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP6-3Q3LI67 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP6-3Q3LI67 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP6-3Q3LI67 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP6-3Q3LI67 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP6-3Q3LI67 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.7 ms