Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI58

KRTAP21-1, Keratin-associated protein 21-1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-1Q3LI58 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 AC011479.1-202ENST00000591889 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 AC233280.19-201ENST00000633223 136 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 AL031432.4-201ENST00000641729 2190 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 GLB1L3-201ENST00000389887 3566 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 EDARADD-204ENST00000637660 2803 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 ABCG8-201ENST00000272286 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 CRELD1-202ENST00000383811 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 AC106788.1-201ENST00000550753 2661 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 CENPL-202ENST00000356198 2357 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 Z97192.2-201ENST00000393264 2379 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 SLC25A18-202ENST00000399813 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 TMEM147-AS1-205ENST00000590717 3300 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 MKRN1-201ENST00000255977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 TRIM46-205ENST00000392451 3195 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 ARPP21-213ENST00000428373 3150 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 LLGL1-203ENST00000621229 3187 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 CASS4-202ENST00000434344 2888 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 C17orf53-202ENST00000319977 2725 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 TJAP1-208ENST00000438588 2716 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 NR1H3-217ENST00000467728 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 FBXO16-202ENST00000380254 1343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 C1RL-201ENST00000266542 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 CBLB-204ENST00000405772 3237 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 PNMA5-203ENST00000439251 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 TRMT2B-203ENST00000372939 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 LDLRAD2-201ENST00000344642 4012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 AL139193.2-201ENST00000553712 1954 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms