Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 AL589935.2-201ENST00000616471 1231 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CSPP1Q1MSJ5 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CSPP1Q1MSJ5 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CSPP1Q1MSJ5 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CSPP1Q1MSJ5 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CSPP1Q1MSJ5 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CSPP1Q1MSJ5 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CSPP1Q1MSJ5 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSPP1Q1MSJ5 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSPP1Q1MSJ5 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSPP1Q1MSJ5 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSPP1Q1MSJ5 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSPP1Q1MSJ5 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSPP1Q1MSJ5 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSPP1Q1MSJ5 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSPP1Q1MSJ5 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSPP1Q1MSJ5 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSPP1Q1MSJ5 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSPP1Q1MSJ5 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSPP1Q1MSJ5 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSPP1Q1MSJ5 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSPP1Q1MSJ5 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSPP1Q1MSJ5 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSPP1Q1MSJ5 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSPP1Q1MSJ5 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
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