Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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