Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPRNQ16849 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPRNQ16849 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPRNQ16849 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPRNQ16849 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPRNQ16849 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPRNQ16849 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPRNQ16849 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPRNQ16849 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPRNQ16849 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPRNQ16849 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPRNQ16849 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPRNQ16849 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPRNQ16849 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPRNQ16849 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPRNQ16849 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPRNQ16849 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPRNQ16849 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPRNQ16849 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPRNQ16849 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPRNQ16849 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPRNQ16849 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPRNQ16849 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPRNQ16849 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPRNQ16849 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPRNQ16849 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPRNQ16849 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPRNQ16849 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRNQ16849 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRNQ16849 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRNQ16849 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRNQ16849 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRNQ16849 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRNQ16849 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRNQ16849 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRNQ16849 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRNQ16849 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRNQ16849 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRNQ16849 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRNQ16849 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRNQ16849 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRNQ16849 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRNQ16849 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRNQ16849 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRNQ16849 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRNQ16849 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRNQ16849 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRNQ16849 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRNQ16849 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRNQ16849 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRNQ16849 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRNQ16849 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRNQ16849 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRNQ16849 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRNQ16849 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRNQ16849 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRNQ16849 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRNQ16849 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRNQ16849 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRNQ16849 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRNQ16849 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRNQ16849 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRNQ16849 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRNQ16849 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRNQ16849 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRNQ16849 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRNQ16849 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRNQ16849 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRNQ16849 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRNQ16849 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRNQ16849 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRNQ16849 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRNQ16849 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRNQ16849 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRNQ16849 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRNQ16849 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRNQ16849 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRNQ16849 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRNQ16849 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRNQ16849 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRNQ16849 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRNQ16849 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRNQ16849 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRNQ16849 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRNQ16849 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRNQ16849 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTPRNQ16849 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTPRNQ16849 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PTPRNQ16849 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTPRNQ16849 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTPRNQ16849 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTPRNQ16849 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTPRNQ16849 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTPRNQ16849 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTPRNQ16849 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTPRNQ16849 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTPRNQ16849 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTPRNQ16849 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PTPRNQ16849 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTPRNQ16849 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms