Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
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SGCBQ16585 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
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SGCBQ16585 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
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SGCBQ16585 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
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