Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

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Length 413 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
E2F4Q16254 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
E2F4Q16254 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
E2F4Q16254 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
E2F4Q16254 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
E2F4Q16254 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
E2F4Q16254 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
E2F4Q16254 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
E2F4Q16254 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
E2F4Q16254 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
E2F4Q16254 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
E2F4Q16254 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
E2F4Q16254 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
E2F4Q16254 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
E2F4Q16254 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
E2F4Q16254 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
E2F4Q16254 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
E2F4Q16254 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
E2F4Q16254 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
E2F4Q16254 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
E2F4Q16254 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
E2F4Q16254 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
E2F4Q16254 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
E2F4Q16254 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
E2F4Q16254 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
E2F4Q16254 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
E2F4Q16254 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
E2F4Q16254 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
E2F4Q16254 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
E2F4Q16254 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
E2F4Q16254 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
E2F4Q16254 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
E2F4Q16254 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
E2F4Q16254 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
E2F4Q16254 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
E2F4Q16254 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
E2F4Q16254 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
E2F4Q16254 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
E2F4Q16254 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
E2F4Q16254 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
E2F4Q16254 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
E2F4Q16254 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
E2F4Q16254 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
E2F4Q16254 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
E2F4Q16254 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
E2F4Q16254 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
E2F4Q16254 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
E2F4Q16254 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
E2F4Q16254 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
E2F4Q16254 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
E2F4Q16254 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
E2F4Q16254 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
E2F4Q16254 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
E2F4Q16254 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
E2F4Q16254 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
E2F4Q16254 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
E2F4Q16254 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
E2F4Q16254 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
E2F4Q16254 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
E2F4Q16254 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
E2F4Q16254 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
E2F4Q16254 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
E2F4Q16254 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
E2F4Q16254 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
E2F4Q16254 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
E2F4Q16254 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
E2F4Q16254 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
E2F4Q16254 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
E2F4Q16254 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
E2F4Q16254 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
E2F4Q16254 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
E2F4Q16254 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
E2F4Q16254 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
E2F4Q16254 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
E2F4Q16254 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
E2F4Q16254 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
E2F4Q16254 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
E2F4Q16254 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
E2F4Q16254 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
E2F4Q16254 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
E2F4Q16254 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
E2F4Q16254 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
E2F4Q16254 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
E2F4Q16254 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
E2F4Q16254 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
E2F4Q16254 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
E2F4Q16254 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
E2F4Q16254 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
E2F4Q16254 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
E2F4Q16254 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
E2F4Q16254 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
E2F4Q16254 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
E2F4Q16254 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
E2F4Q16254 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
E2F4Q16254 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
E2F4Q16254 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
E2F4Q16254 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
E2F4Q16254 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
E2F4Q16254 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
E2F4Q16254 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
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