Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 AC136624.2-201ENST00000574883 542 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
VPS72Q15906 NAMA-206ENST00000605377 509 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
VPS72Q15906 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
VPS72Q15906 AC114296.1-204ENST00000637197 1173 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
VPS72Q15906 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
VPS72Q15906 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
VPS72Q15906 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
VPS72Q15906 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
VPS72Q15906 RELL1-201ENST00000314117 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
VPS72Q15906 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
VPS72Q15906 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
VPS72Q15906 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
VPS72Q15906 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
VPS72Q15906 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
VPS72Q15906 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
VPS72Q15906 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
VPS72Q15906 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
VPS72Q15906 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
VPS72Q15906 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
VPS72Q15906 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
VPS72Q15906 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
VPS72Q15906 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
VPS72Q15906 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
VPS72Q15906 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
VPS72Q15906 MMP7-201ENST00000260227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
VPS72Q15906 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
VPS72Q15906 AL357373.1-201ENST00000394974 322 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
VPS72Q15906 LIF-202ENST00000403987 592 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
VPS72Q15906 CTHRC1-202ENST00000415886 571 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
VPS72Q15906 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
VPS72Q15906 DMKN-256ENST00000492341 738 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
VPS72Q15906 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
VPS72Q15906 PRB3-202ENST00000538488 1283 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
VPS72Q15906 ZNF268-210ENST00000541211 781 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
VPS72Q15906 AC020659.1-202ENST00000564432 531 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
VPS72Q15906 AC027139.1-201ENST00000565286 951 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
VPS72Q15906 AC136944.4-201ENST00000568893 660 ntTSL 4 BASIC19.69■□□□□ 0.74
VPS72Q15906 AC055811.3-201ENST00000584952 686 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
VPS72Q15906 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
VPS72Q15906 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
VPS72Q15906 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
VPS72Q15906 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
VPS72Q15906 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
VPS72Q15906 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
VPS72Q15906 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
VPS72Q15906 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
VPS72Q15906 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
VPS72Q15906 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
VPS72Q15906 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
VPS72Q15906 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
VPS72Q15906 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
VPS72Q15906 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
VPS72Q15906 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
VPS72Q15906 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
VPS72Q15906 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
VPS72Q15906 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
VPS72Q15906 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
VPS72Q15906 AURKB-201ENST00000316199 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
VPS72Q15906 C7orf61-201ENST00000332375 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
VPS72Q15906 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
VPS72Q15906 TNNT2-203ENST00000367315 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
VPS72Q15906 KLK11-203ENST00000391804 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
VPS72Q15906 MAPK3-204ENST00000395200 997 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
VPS72Q15906 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
VPS72Q15906 AL137058.1-201ENST00000418237 673 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
VPS72Q15906 ITGA9-AS1-205ENST00000438136 578 ntTSL 4 BASIC19.68■□□□□ 0.74
VPS72Q15906 DARS-AS1-204ENST00000444406 442 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
VPS72Q15906 DPY19L2P5-201ENST00000456300 331 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
VPS72Q15906 TMEM222-204ENST00000466759 368 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
VPS72Q15906 ROPN1B-203ENST00000505382 713 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
VPS72Q15906 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
VPS72Q15906 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
VPS72Q15906 MIA-206ENST00000597784 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
VPS72Q15906 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
VPS72Q15906 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
VPS72Q15906 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
VPS72Q15906 TNFRSF1A-202ENST00000366159 1339 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
VPS72Q15906 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
VPS72Q15906 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
VPS72Q15906 IL1F10-202ENST00000393197 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
VPS72Q15906 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
VPS72Q15906 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
VPS72Q15906 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
VPS72Q15906 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
VPS72Q15906 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
VPS72Q15906 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
VPS72Q15906 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
VPS72Q15906 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
VPS72Q15906 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
VPS72Q15906 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
VPS72Q15906 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
VPS72Q15906 C11orf49-203ENST00000378618 1166 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
VPS72Q15906 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
VPS72Q15906 AL354892.2-201ENST00000413088 403 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
VPS72Q15906 AC097059.1-201ENST00000413103 885 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
VPS72Q15906 AC093627.2-201ENST00000497017 568 ntTSL 4 BASIC19.67■□□□□ 0.74
VPS72Q15906 AP003068.3-201ENST00000527789 175 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
VPS72Q15906 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
VPS72Q15906 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
VPS72Q15906 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
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