Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

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Length 529 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDSNQ15517 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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CDSNQ15517 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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CDSNQ15517 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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CDSNQ15517 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
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CDSNQ15517 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
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