Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 AL355816.2-201ENST00000610049 647 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 AL139353.2-202ENST00000502430 1213 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 AC093783.1-201ENST00000612976 329 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
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