Protein–RNA interactions for Protein: Q14094

CCNI, Cyclin-I, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNIQ14094 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCNIQ14094 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCNIQ14094 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCNIQ14094 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCNIQ14094 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCNIQ14094 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCNIQ14094 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCNIQ14094 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCNIQ14094 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCNIQ14094 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCNIQ14094 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCNIQ14094 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCNIQ14094 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCNIQ14094 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCNIQ14094 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCNIQ14094 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCNIQ14094 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCNIQ14094 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCNIQ14094 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
CCNIQ14094 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCNIQ14094 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCNIQ14094 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCNIQ14094 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCNIQ14094 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCNIQ14094 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCNIQ14094 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCNIQ14094 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCNIQ14094 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCNIQ14094 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCNIQ14094 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCNIQ14094 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCNIQ14094 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCNIQ14094 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCNIQ14094 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCNIQ14094 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCNIQ14094 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCNIQ14094 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCNIQ14094 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCNIQ14094 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
CCNIQ14094 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCNIQ14094 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCNIQ14094 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCNIQ14094 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCNIQ14094 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCNIQ14094 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
CCNIQ14094 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
CCNIQ14094 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCNIQ14094 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCNIQ14094 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCNIQ14094 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCNIQ14094 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
CCNIQ14094 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCNIQ14094 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCNIQ14094 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCNIQ14094 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCNIQ14094 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
CCNIQ14094 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
CCNIQ14094 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCNIQ14094 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCNIQ14094 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCNIQ14094 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCNIQ14094 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCNIQ14094 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCNIQ14094 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCNIQ14094 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCNIQ14094 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCNIQ14094 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCNIQ14094 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
CCNIQ14094 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCNIQ14094 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCNIQ14094 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCNIQ14094 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCNIQ14094 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCNIQ14094 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCNIQ14094 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCNIQ14094 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCNIQ14094 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCNIQ14094 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCNIQ14094 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCNIQ14094 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCNIQ14094 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCNIQ14094 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCNIQ14094 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCNIQ14094 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCNIQ14094 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCNIQ14094 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCNIQ14094 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCNIQ14094 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCNIQ14094 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCNIQ14094 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCNIQ14094 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCNIQ14094 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCNIQ14094 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCNIQ14094 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCNIQ14094 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCNIQ14094 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCNIQ14094 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCNIQ14094 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCNIQ14094 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CCNIQ14094 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms