Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNGB1Q14028 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNGB1Q14028 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNGB1Q14028 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNGB1Q14028 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNGB1Q14028 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNGB1Q14028 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNGB1Q14028 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNGB1Q14028 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNGB1Q14028 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNGB1Q14028 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNGB1Q14028 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNGB1Q14028 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNGB1Q14028 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CNGB1Q14028 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNGB1Q14028 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNGB1Q14028 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNGB1Q14028 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNGB1Q14028 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNGB1Q14028 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNGB1Q14028 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNGB1Q14028 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNGB1Q14028 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNGB1Q14028 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNGB1Q14028 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNGB1Q14028 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNGB1Q14028 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNGB1Q14028 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNGB1Q14028 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNGB1Q14028 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNGB1Q14028 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNGB1Q14028 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNGB1Q14028 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNGB1Q14028 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNGB1Q14028 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNGB1Q14028 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNGB1Q14028 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNGB1Q14028 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNGB1Q14028 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CNGB1Q14028 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNGB1Q14028 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNGB1Q14028 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNGB1Q14028 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CNGB1Q14028 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CNGB1Q14028 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNGB1Q14028 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNGB1Q14028 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CNGB1Q14028 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNGB1Q14028 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNGB1Q14028 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNGB1Q14028 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNGB1Q14028 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNGB1Q14028 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNGB1Q14028 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNGB1Q14028 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNGB1Q14028 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNGB1Q14028 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CNGB1Q14028 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CNGB1Q14028 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
CNGB1Q14028 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
CNGB1Q14028 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNGB1Q14028 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNGB1Q14028 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNGB1Q14028 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNGB1Q14028 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNGB1Q14028 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNGB1Q14028 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNGB1Q14028 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNGB1Q14028 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNGB1Q14028 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNGB1Q14028 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNGB1Q14028 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNGB1Q14028 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNGB1Q14028 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNGB1Q14028 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CNGB1Q14028 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNGB1Q14028 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNGB1Q14028 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNGB1Q14028 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNGB1Q14028 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNGB1Q14028 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNGB1Q14028 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNGB1Q14028 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNGB1Q14028 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNGB1Q14028 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNGB1Q14028 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNGB1Q14028 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNGB1Q14028 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNGB1Q14028 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNGB1Q14028 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNGB1Q14028 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNGB1Q14028 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNGB1Q14028 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNGB1Q14028 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNGB1Q14028 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNGB1Q14028 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNGB1Q14028 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNGB1Q14028 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNGB1Q14028 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNGB1Q14028 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
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