Protein–RNA interactions for Protein: Q14004

CDK13, Cyclin-dependent kinase 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK13Q14004 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDK13Q14004 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDK13Q14004 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDK13Q14004 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDK13Q14004 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDK13Q14004 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDK13Q14004 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDK13Q14004 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDK13Q14004 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDK13Q14004 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDK13Q14004 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDK13Q14004 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CDK13Q14004 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDK13Q14004 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDK13Q14004 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDK13Q14004 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDK13Q14004 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDK13Q14004 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDK13Q14004 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDK13Q14004 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDK13Q14004 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDK13Q14004 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDK13Q14004 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDK13Q14004 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDK13Q14004 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDK13Q14004 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDK13Q14004 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDK13Q14004 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDK13Q14004 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CDK13Q14004 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDK13Q14004 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDK13Q14004 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDK13Q14004 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDK13Q14004 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CDK13Q14004 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDK13Q14004 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDK13Q14004 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDK13Q14004 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDK13Q14004 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDK13Q14004 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDK13Q14004 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDK13Q14004 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDK13Q14004 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDK13Q14004 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDK13Q14004 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CDK13Q14004 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDK13Q14004 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDK13Q14004 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDK13Q14004 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CDK13Q14004 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CDK13Q14004 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CDK13Q14004 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDK13Q14004 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDK13Q14004 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDK13Q14004 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDK13Q14004 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CDK13Q14004 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CDK13Q14004 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDK13Q14004 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDK13Q14004 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDK13Q14004 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CDK13Q14004 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CDK13Q14004 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDK13Q14004 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDK13Q14004 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDK13Q14004 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDK13Q14004 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDK13Q14004 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CDK13Q14004 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CDK13Q14004 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDK13Q14004 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDK13Q14004 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDK13Q14004 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDK13Q14004 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDK13Q14004 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDK13Q14004 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDK13Q14004 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDK13Q14004 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDK13Q14004 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDK13Q14004 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDK13Q14004 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDK13Q14004 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDK13Q14004 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDK13Q14004 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDK13Q14004 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDK13Q14004 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDK13Q14004 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CDK13Q14004 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDK13Q14004 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDK13Q14004 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDK13Q14004 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDK13Q14004 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDK13Q14004 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDK13Q14004 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDK13Q14004 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDK13Q14004 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CDK13Q14004 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDK13Q14004 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CDK13Q14004 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CDK13Q14004 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
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