Protein–RNA interactions for Protein: Q14003

KCNC3, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 3, humanhuman

Predictions only

Length 757 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC3Q14003 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNC3Q14003 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNC3Q14003 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNC3Q14003 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNC3Q14003 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNC3Q14003 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNC3Q14003 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNC3Q14003 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNC3Q14003 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNC3Q14003 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNC3Q14003 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNC3Q14003 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNC3Q14003 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNC3Q14003 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNC3Q14003 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNC3Q14003 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNC3Q14003 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNC3Q14003 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNC3Q14003 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNC3Q14003 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNC3Q14003 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNC3Q14003 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNC3Q14003 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNC3Q14003 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNC3Q14003 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNC3Q14003 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNC3Q14003 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNC3Q14003 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNC3Q14003 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNC3Q14003 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNC3Q14003 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNC3Q14003 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNC3Q14003 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNC3Q14003 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNC3Q14003 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNC3Q14003 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNC3Q14003 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNC3Q14003 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNC3Q14003 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNC3Q14003 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNC3Q14003 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNC3Q14003 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNC3Q14003 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNC3Q14003 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNC3Q14003 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNC3Q14003 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNC3Q14003 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNC3Q14003 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNC3Q14003 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNC3Q14003 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNC3Q14003 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNC3Q14003 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNC3Q14003 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNC3Q14003 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNC3Q14003 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNC3Q14003 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNC3Q14003 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNC3Q14003 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNC3Q14003 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNC3Q14003 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNC3Q14003 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNC3Q14003 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNC3Q14003 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNC3Q14003 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNC3Q14003 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNC3Q14003 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
KCNC3Q14003 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KCNC3Q14003 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
KCNC3Q14003 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
KCNC3Q14003 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KCNC3Q14003 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
KCNC3Q14003 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KCNC3Q14003 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KCNC3Q14003 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
KCNC3Q14003 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
KCNC3Q14003 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
KCNC3Q14003 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNC3Q14003 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNC3Q14003 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNC3Q14003 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNC3Q14003 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNC3Q14003 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNC3Q14003 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNC3Q14003 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNC3Q14003 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNC3Q14003 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNC3Q14003 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNC3Q14003 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNC3Q14003 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNC3Q14003 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNC3Q14003 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNC3Q14003 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNC3Q14003 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNC3Q14003 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNC3Q14003 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNC3Q14003 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNC3Q14003 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNC3Q14003 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNC3Q14003 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNC3Q14003 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms