Protein–RNA interactions for Protein: Q13751

LAMB3, Laminin subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB3Q13751 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms