Protein–RNA interactions for Protein: Q13630

TSTA3, GDP-L-fucose synthase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSTA3Q13630 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TSTA3Q13630 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TSTA3Q13630 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TSTA3Q13630 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TSTA3Q13630 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TSTA3Q13630 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TSTA3Q13630 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TSTA3Q13630 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TSTA3Q13630 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TSTA3Q13630 PPFIA4-203ENST00000367240 6434 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TSTA3Q13630 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TSTA3Q13630 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TSTA3Q13630 ADGRL1-201ENST00000340736 7853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TSTA3Q13630 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TSTA3Q13630 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TSTA3Q13630 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TSTA3Q13630 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TSTA3Q13630 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TSTA3Q13630 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TSTA3Q13630 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TSTA3Q13630 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TSTA3Q13630 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TSTA3Q13630 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TSTA3Q13630 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TSTA3Q13630 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TSTA3Q13630 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TSTA3Q13630 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TSTA3Q13630 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TSTA3Q13630 TFAM-204ENST00000487519 5414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TSTA3Q13630 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TSTA3Q13630 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TSTA3Q13630 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TSTA3Q13630 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TSTA3Q13630 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TSTA3Q13630 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TSTA3Q13630 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TSTA3Q13630 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TSTA3Q13630 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TSTA3Q13630 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TSTA3Q13630 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TSTA3Q13630 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TSTA3Q13630 SPECC1L-ADORA2A-201ENST00000358654 6204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TSTA3Q13630 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TSTA3Q13630 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TSTA3Q13630 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TSTA3Q13630 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TSTA3Q13630 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TSTA3Q13630 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TSTA3Q13630 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TSTA3Q13630 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TSTA3Q13630 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TSTA3Q13630 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TSTA3Q13630 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TSTA3Q13630 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TSTA3Q13630 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TSTA3Q13630 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TSTA3Q13630 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TSTA3Q13630 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TSTA3Q13630 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TSTA3Q13630 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TSTA3Q13630 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TSTA3Q13630 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TSTA3Q13630 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TSTA3Q13630 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TSTA3Q13630 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TSTA3Q13630 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TSTA3Q13630 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TSTA3Q13630 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TSTA3Q13630 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TSTA3Q13630 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TSTA3Q13630 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TSTA3Q13630 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TSTA3Q13630 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TSTA3Q13630 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TSTA3Q13630 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TSTA3Q13630 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TSTA3Q13630 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TSTA3Q13630 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TSTA3Q13630 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TSTA3Q13630 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TSTA3Q13630 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TSTA3Q13630 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TSTA3Q13630 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TSTA3Q13630 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TSTA3Q13630 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TSTA3Q13630 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TSTA3Q13630 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TSTA3Q13630 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TSTA3Q13630 TSPOAP1-201ENST00000268893 7483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TSTA3Q13630 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TSTA3Q13630 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TSTA3Q13630 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TSTA3Q13630 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TSTA3Q13630 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TSTA3Q13630 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TSTA3Q13630 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TSTA3Q13630 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TSTA3Q13630 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TSTA3Q13630 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TSTA3Q13630 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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