Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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