Protein–RNA interactions for Protein: Q13296

SCGB2A2, Mammaglobin-A, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB2A2Q13296 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SCGB2A2Q13296 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SCGB2A2Q13296 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SCGB2A2Q13296 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
SCGB2A2Q13296 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SCGB2A2Q13296 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
SCGB2A2Q13296 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SCGB2A2Q13296 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SCGB2A2Q13296 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SCGB2A2Q13296 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
SCGB2A2Q13296 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
SCGB2A2Q13296 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SCGB2A2Q13296 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
SCGB2A2Q13296 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SCGB2A2Q13296 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SCGB2A2Q13296 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SCGB2A2Q13296 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
SCGB2A2Q13296 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SCGB2A2Q13296 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
SCGB2A2Q13296 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
SCGB2A2Q13296 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
SCGB2A2Q13296 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
SCGB2A2Q13296 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SCGB2A2Q13296 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SCGB2A2Q13296 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SCGB2A2Q13296 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SCGB2A2Q13296 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SCGB2A2Q13296 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SCGB2A2Q13296 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SCGB2A2Q13296 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SCGB2A2Q13296 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SCGB2A2Q13296 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SCGB2A2Q13296 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SCGB2A2Q13296 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SCGB2A2Q13296 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SCGB2A2Q13296 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SCGB2A2Q13296 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SCGB2A2Q13296 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SCGB2A2Q13296 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SCGB2A2Q13296 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SCGB2A2Q13296 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SCGB2A2Q13296 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SCGB2A2Q13296 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SCGB2A2Q13296 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SCGB2A2Q13296 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SCGB2A2Q13296 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SCGB2A2Q13296 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
SCGB2A2Q13296 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
SCGB2A2Q13296 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
SCGB2A2Q13296 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
SCGB2A2Q13296 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
SCGB2A2Q13296 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
SCGB2A2Q13296 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
SCGB2A2Q13296 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
SCGB2A2Q13296 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.36
SCGB2A2Q13296 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.77□□□□□ -0.36
SCGB2A2Q13296 PRKCB-201ENST00000303531 7969 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
SCGB2A2Q13296 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
SCGB2A2Q13296 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
SCGB2A2Q13296 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
SCGB2A2Q13296 CELSR1-201ENST00000262738 11389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
SCGB2A2Q13296 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
SCGB2A2Q13296 TMEM2-202ENST00000377044 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
SCGB2A2Q13296 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
SCGB2A2Q13296 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
SCGB2A2Q13296 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SCGB2A2Q13296 GSE1-201ENST00000253458 7495 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SCGB2A2Q13296 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SCGB2A2Q13296 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SCGB2A2Q13296 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SCGB2A2Q13296 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SCGB2A2Q13296 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
SCGB2A2Q13296 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SCGB2A2Q13296 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
SCGB2A2Q13296 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SCGB2A2Q13296 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SCGB2A2Q13296 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SCGB2A2Q13296 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SCGB2A2Q13296 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
SCGB2A2Q13296 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SCGB2A2Q13296 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SCGB2A2Q13296 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
SCGB2A2Q13296 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SCGB2A2Q13296 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SCGB2A2Q13296 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SCGB2A2Q13296 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SCGB2A2Q13296 DDX3X-201ENST00000399959 5399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SCGB2A2Q13296 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SCGB2A2Q13296 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SCGB2A2Q13296 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SCGB2A2Q13296 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SCGB2A2Q13296 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SCGB2A2Q13296 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SCGB2A2Q13296 TLL2-201ENST00000357947 6756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SCGB2A2Q13296 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SCGB2A2Q13296 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SCGB2A2Q13296 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SCGB2A2Q13296 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SCGB2A2Q13296 AJAP1-202ENST00000378191 11666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SCGB2A2Q13296 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms