Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

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Length 394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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