Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CSTF3Q12996 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CSTF3Q12996 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CSTF3Q12996 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CSTF3Q12996 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CSTF3Q12996 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CSTF3Q12996 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CSTF3Q12996 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CSTF3Q12996 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CSTF3Q12996 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CSTF3Q12996 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CSTF3Q12996 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CSTF3Q12996 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CSTF3Q12996 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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CSTF3Q12996 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CSTF3Q12996 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CSTF3Q12996 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CSTF3Q12996 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
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CSTF3Q12996 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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CSTF3Q12996 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CSTF3Q12996 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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CSTF3Q12996 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CSTF3Q12996 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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CSTF3Q12996 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
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CSTF3Q12996 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CSTF3Q12996 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
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CSTF3Q12996 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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CSTF3Q12996 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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CSTF3Q12996 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CSTF3Q12996 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CSTF3Q12996 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CSTF3Q12996 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CSTF3Q12996 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CSTF3Q12996 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CSTF3Q12996 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CSTF3Q12996 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CSTF3Q12996 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CSTF3Q12996 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CSTF3Q12996 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CSTF3Q12996 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CSTF3Q12996 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CSTF3Q12996 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CSTF3Q12996 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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