Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
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FOXF1Q12946 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FOXF1Q12946 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FOXF1Q12946 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FOXF1Q12946 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FOXF1Q12946 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
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FOXF1Q12946 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
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FOXF1Q12946 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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FOXF1Q12946 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
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FOXF1Q12946 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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FOXF1Q12946 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FOXF1Q12946 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
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FOXF1Q12946 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
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FOXF1Q12946 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
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FOXF1Q12946 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
FOXF1Q12946 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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FOXF1Q12946 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
FOXF1Q12946 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
FOXF1Q12946 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
FOXF1Q12946 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
FOXF1Q12946 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
FOXF1Q12946 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
FOXF1Q12946 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
FOXF1Q12946 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
FOXF1Q12946 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
FOXF1Q12946 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
FOXF1Q12946 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC13.96□□□□□ -0.17
FOXF1Q12946 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
FOXF1Q12946 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
FOXF1Q12946 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
FOXF1Q12946 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
FOXF1Q12946 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
FOXF1Q12946 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
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