Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

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Length 1,141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SREBF2Q12772 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SREBF2Q12772 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SREBF2Q12772 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SREBF2Q12772 TCERG1L-AS1-201ENST00000436942 472 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SREBF2Q12772 AL139008.1-201ENST00000437894 228 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SREBF2Q12772 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SREBF2Q12772 MIR503HG-202ENST00000440570 760 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SREBF2Q12772 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SREBF2Q12772 RPS25-202ENST00000527673 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SREBF2Q12772 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SREBF2Q12772 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SREBF2Q12772 CRTC3-AS1-202ENST00000559531 657 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SREBF2Q12772 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SREBF2Q12772 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SREBF2Q12772 AC138466.4-201ENST00000623965 852 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SREBF2Q12772 LINC00969-257ENST00000625632 898 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SREBF2Q12772 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SREBF2Q12772 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SREBF2Q12772 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SREBF2Q12772 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SREBF2Q12772 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SREBF2Q12772 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SREBF2Q12772 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SREBF2Q12772 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SREBF2Q12772 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SREBF2Q12772 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SREBF2Q12772 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SREBF2Q12772 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SREBF2Q12772 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SREBF2Q12772 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SREBF2Q12772 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SREBF2Q12772 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SREBF2Q12772 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SREBF2Q12772 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SREBF2Q12772 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SREBF2Q12772 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SREBF2Q12772 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SREBF2Q12772 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SREBF2Q12772 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SREBF2Q12772 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SREBF2Q12772 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SREBF2Q12772 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SREBF2Q12772 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SREBF2Q12772 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SREBF2Q12772 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SREBF2Q12772 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SREBF2Q12772 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SREBF2Q12772 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SREBF2Q12772 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SREBF2Q12772 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SREBF2Q12772 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SREBF2Q12772 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SREBF2Q12772 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SREBF2Q12772 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SREBF2Q12772 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SREBF2Q12772 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SREBF2Q12772 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SREBF2Q12772 CLNS1A-211ENST00000532069 898 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SREBF2Q12772 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SREBF2Q12772 AL022344.2-201ENST00000568976 968 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SREBF2Q12772 INCA1-203ENST00000575780 1221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SREBF2Q12772 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SREBF2Q12772 FO393412.1-201ENST00000619841 382 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SREBF2Q12772 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SREBF2Q12772 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SREBF2Q12772 AC104333.4-201ENST00000632866 554 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SREBF2Q12772 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SREBF2Q12772 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SREBF2Q12772 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SREBF2Q12772 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SREBF2Q12772 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SREBF2Q12772 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SREBF2Q12772 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SREBF2Q12772 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SREBF2Q12772 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SREBF2Q12772 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SREBF2Q12772 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SREBF2Q12772 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SREBF2Q12772 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SREBF2Q12772 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SREBF2Q12772 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SREBF2Q12772 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SREBF2Q12772 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SREBF2Q12772 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SREBF2Q12772 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SREBF2Q12772 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SREBF2Q12772 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SREBF2Q12772 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SREBF2Q12772 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SREBF2Q12772 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SREBF2Q12772 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SREBF2Q12772 Metazoa_SRP.100-201ENST00000447610 282 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SREBF2Q12772 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SREBF2Q12772 AC009119.2-201ENST00000561562 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SREBF2Q12772 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SREBF2Q12772 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SREBF2Q12772 UXT-AS1-202ENST00000591832 565 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SREBF2Q12772 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SREBF2Q12772 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
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