Protein–RNA interactions for Protein: Q07654

TFF3, Trefoil factor 3, humanhuman

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Length 80 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFF3Q07654 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TFF3Q07654 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TFF3Q07654 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TFF3Q07654 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TFF3Q07654 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TFF3Q07654 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TFF3Q07654 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TFF3Q07654 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TFF3Q07654 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TFF3Q07654 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TFF3Q07654 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TFF3Q07654 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TFF3Q07654 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TFF3Q07654 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TFF3Q07654 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TFF3Q07654 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TFF3Q07654 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TFF3Q07654 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TFF3Q07654 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TFF3Q07654 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TFF3Q07654 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TFF3Q07654 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TFF3Q07654 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TFF3Q07654 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TFF3Q07654 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TFF3Q07654 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TFF3Q07654 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
TFF3Q07654 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TFF3Q07654 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
TFF3Q07654 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
TFF3Q07654 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
TFF3Q07654 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TFF3Q07654 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
TFF3Q07654 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TFF3Q07654 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
TFF3Q07654 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
TFF3Q07654 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TFF3Q07654 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TFF3Q07654 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TFF3Q07654 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TFF3Q07654 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TFF3Q07654 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TFF3Q07654 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TFF3Q07654 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TFF3Q07654 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TFF3Q07654 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TFF3Q07654 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TFF3Q07654 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TFF3Q07654 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TFF3Q07654 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TFF3Q07654 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TFF3Q07654 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TFF3Q07654 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TFF3Q07654 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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TFF3Q07654 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
TFF3Q07654 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TFF3Q07654 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TFF3Q07654 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TFF3Q07654 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TFF3Q07654 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TFF3Q07654 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TFF3Q07654 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
TFF3Q07654 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TFF3Q07654 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TFF3Q07654 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TFF3Q07654 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TFF3Q07654 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TFF3Q07654 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
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TFF3Q07654 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
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TFF3Q07654 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TFF3Q07654 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
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TFF3Q07654 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TFF3Q07654 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TFF3Q07654 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
TFF3Q07654 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TFF3Q07654 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TFF3Q07654 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TFF3Q07654 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TFF3Q07654 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TFF3Q07654 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TFF3Q07654 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
TFF3Q07654 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TFF3Q07654 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TFF3Q07654 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TFF3Q07654 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TFF3Q07654 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TFF3Q07654 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TFF3Q07654 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TFF3Q07654 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TFF3Q07654 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TFF3Q07654 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TFF3Q07654 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TFF3Q07654 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TFF3Q07654 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TFF3Q07654 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
TFF3Q07654 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
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