Protein–RNA interactions for Protein: Q06609

RAD51, DNA repair protein RAD51 homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51Q06609 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAD51Q06609 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RAD51Q06609 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAD51Q06609 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAD51Q06609 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAD51Q06609 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAD51Q06609 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAD51Q06609 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAD51Q06609 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAD51Q06609 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAD51Q06609 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAD51Q06609 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RAD51Q06609 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAD51Q06609 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAD51Q06609 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAD51Q06609 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAD51Q06609 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAD51Q06609 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAD51Q06609 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAD51Q06609 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RAD51Q06609 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RAD51Q06609 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAD51Q06609 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAD51Q06609 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAD51Q06609 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAD51Q06609 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAD51Q06609 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAD51Q06609 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAD51Q06609 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAD51Q06609 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAD51Q06609 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAD51Q06609 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RAD51Q06609 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAD51Q06609 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAD51Q06609 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAD51Q06609 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAD51Q06609 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAD51Q06609 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAD51Q06609 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAD51Q06609 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAD51Q06609 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAD51Q06609 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAD51Q06609 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAD51Q06609 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAD51Q06609 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAD51Q06609 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAD51Q06609 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAD51Q06609 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAD51Q06609 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAD51Q06609 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAD51Q06609 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RAD51Q06609 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RAD51Q06609 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAD51Q06609 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAD51Q06609 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAD51Q06609 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAD51Q06609 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAD51Q06609 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAD51Q06609 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RAD51Q06609 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAD51Q06609 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAD51Q06609 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RAD51Q06609 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAD51Q06609 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAD51Q06609 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAD51Q06609 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAD51Q06609 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAD51Q06609 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAD51Q06609 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAD51Q06609 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAD51Q06609 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAD51Q06609 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAD51Q06609 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAD51Q06609 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAD51Q06609 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAD51Q06609 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAD51Q06609 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAD51Q06609 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAD51Q06609 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAD51Q06609 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAD51Q06609 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAD51Q06609 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAD51Q06609 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAD51Q06609 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAD51Q06609 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAD51Q06609 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAD51Q06609 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAD51Q06609 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAD51Q06609 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAD51Q06609 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAD51Q06609 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAD51Q06609 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAD51Q06609 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAD51Q06609 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAD51Q06609 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAD51Q06609 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAD51Q06609 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAD51Q06609 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAD51Q06609 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAD51Q06609 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms