Protein–RNA interactions for Protein: Q06547

GABPB1, GA-binding protein subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1Q06547 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 GRM1-203ENST00000361719 6754 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 FAM168B-202ENST00000409185 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 DUOXA1-205ENST00000558422 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 RPS6KC1-206ENST00000543354 4082 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 HMGCL-203ENST00000374490 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 MIRLET7BHG-201ENST00000360737 4560 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 ADRA2B-201ENST00000620793 3371 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 VGLL3-202ENST00000398399 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 USP2-201ENST00000260187 3732 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 SFTPA1-202ENST00000419470 2210 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 AC024075.2-201ENST00000598112 1473 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 SMPDL3B-206ENST00000549094 1611 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 MEP1A-201ENST00000230588 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 NFATC1-204ENST00000397790 3453 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 BCAM-211ENST00000611077 3430 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 HYOU1-220ENST00000617285 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 AC012531.1-201ENST00000562848 2680 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 MPRIP-202ENST00000341712 3846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 ZC3H18-201ENST00000301011 3729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 ADAMTSL4-203ENST00000369039 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 LIPE-201ENST00000244289 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms