Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms