Protein–RNA interactions for Protein: Q05086

UBE3A, Ubiquitin-protein ligase E3A, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3AQ05086 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
UBE3AQ05086 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
UBE3AQ05086 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
UBE3AQ05086 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
UBE3AQ05086 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
UBE3AQ05086 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
UBE3AQ05086 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
UBE3AQ05086 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms