Protein–RNA interactions for Protein: Q02297

NRG1, Pro-neuregulin-1, membrane-bound isoform, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRG1Q02297 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NRG1Q02297 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NRG1Q02297 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NRG1Q02297 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NRG1Q02297 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NRG1Q02297 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NRG1Q02297 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NRG1Q02297 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NRG1Q02297 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NRG1Q02297 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NRG1Q02297 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NRG1Q02297 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NRG1Q02297 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NRG1Q02297 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NRG1Q02297 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
NRG1Q02297 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NRG1Q02297 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NRG1Q02297 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NRG1Q02297 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NRG1Q02297 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NRG1Q02297 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
NRG1Q02297 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
NRG1Q02297 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NRG1Q02297 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
NRG1Q02297 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NRG1Q02297 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NRG1Q02297 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NRG1Q02297 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NRG1Q02297 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NRG1Q02297 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NRG1Q02297 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NRG1Q02297 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NRG1Q02297 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NRG1Q02297 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NRG1Q02297 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NRG1Q02297 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NRG1Q02297 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NRG1Q02297 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NRG1Q02297 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NRG1Q02297 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NRG1Q02297 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NRG1Q02297 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NRG1Q02297 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NRG1Q02297 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NRG1Q02297 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NRG1Q02297 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NRG1Q02297 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NRG1Q02297 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NRG1Q02297 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NRG1Q02297 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NRG1Q02297 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NRG1Q02297 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NRG1Q02297 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NRG1Q02297 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
NRG1Q02297 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NRG1Q02297 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NRG1Q02297 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
NRG1Q02297 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NRG1Q02297 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NRG1Q02297 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NRG1Q02297 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NRG1Q02297 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NRG1Q02297 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NRG1Q02297 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
NRG1Q02297 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NRG1Q02297 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NRG1Q02297 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NRG1Q02297 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NRG1Q02297 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NRG1Q02297 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NRG1Q02297 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NRG1Q02297 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NRG1Q02297 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NRG1Q02297 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NRG1Q02297 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NRG1Q02297 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NRG1Q02297 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NRG1Q02297 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NRG1Q02297 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NRG1Q02297 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NRG1Q02297 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NRG1Q02297 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NRG1Q02297 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NRG1Q02297 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NRG1Q02297 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NRG1Q02297 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NRG1Q02297 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NRG1Q02297 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NRG1Q02297 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NRG1Q02297 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NRG1Q02297 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NRG1Q02297 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NRG1Q02297 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NRG1Q02297 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NRG1Q02297 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NRG1Q02297 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NRG1Q02297 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
NRG1Q02297 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NRG1Q02297 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NRG1Q02297 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms