Protein–RNA interactions for Protein: Q01850

CDR2, Cerebellar degeneration-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDR2Q01850 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CDR2Q01850 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDR2Q01850 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDR2Q01850 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDR2Q01850 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDR2Q01850 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDR2Q01850 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDR2Q01850 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDR2Q01850 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDR2Q01850 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDR2Q01850 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDR2Q01850 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDR2Q01850 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDR2Q01850 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDR2Q01850 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDR2Q01850 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CDR2Q01850 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDR2Q01850 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDR2Q01850 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDR2Q01850 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDR2Q01850 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDR2Q01850 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDR2Q01850 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDR2Q01850 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CDR2Q01850 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDR2Q01850 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDR2Q01850 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDR2Q01850 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDR2Q01850 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDR2Q01850 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDR2Q01850 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDR2Q01850 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDR2Q01850 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDR2Q01850 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDR2Q01850 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDR2Q01850 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDR2Q01850 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDR2Q01850 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDR2Q01850 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDR2Q01850 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDR2Q01850 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDR2Q01850 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDR2Q01850 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CDR2Q01850 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDR2Q01850 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDR2Q01850 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CDR2Q01850 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDR2Q01850 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDR2Q01850 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDR2Q01850 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDR2Q01850 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDR2Q01850 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDR2Q01850 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDR2Q01850 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDR2Q01850 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CDR2Q01850 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDR2Q01850 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDR2Q01850 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDR2Q01850 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDR2Q01850 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDR2Q01850 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CDR2Q01850 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CDR2Q01850 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDR2Q01850 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CDR2Q01850 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDR2Q01850 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDR2Q01850 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDR2Q01850 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDR2Q01850 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDR2Q01850 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDR2Q01850 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDR2Q01850 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDR2Q01850 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDR2Q01850 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDR2Q01850 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDR2Q01850 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDR2Q01850 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CDR2Q01850 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CDR2Q01850 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDR2Q01850 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDR2Q01850 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDR2Q01850 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDR2Q01850 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDR2Q01850 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDR2Q01850 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDR2Q01850 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDR2Q01850 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDR2Q01850 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDR2Q01850 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDR2Q01850 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDR2Q01850 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDR2Q01850 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDR2Q01850 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDR2Q01850 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDR2Q01850 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDR2Q01850 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CDR2Q01850 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDR2Q01850 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDR2Q01850 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDR2Q01850 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68 ms