Protein–RNA interactions for Protein: Q01831

XPC, DNA repair protein complementing XP-C cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPCQ01831 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
XPCQ01831 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
XPCQ01831 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
XPCQ01831 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
XPCQ01831 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
XPCQ01831 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
XPCQ01831 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
XPCQ01831 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
XPCQ01831 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
XPCQ01831 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
XPCQ01831 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
XPCQ01831 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
XPCQ01831 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
XPCQ01831 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
XPCQ01831 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
XPCQ01831 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
XPCQ01831 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
XPCQ01831 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
XPCQ01831 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
XPCQ01831 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
XPCQ01831 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
XPCQ01831 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
XPCQ01831 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
XPCQ01831 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
XPCQ01831 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
XPCQ01831 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
XPCQ01831 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
XPCQ01831 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
XPCQ01831 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
XPCQ01831 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
XPCQ01831 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
XPCQ01831 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
XPCQ01831 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
XPCQ01831 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
XPCQ01831 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
XPCQ01831 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
XPCQ01831 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
XPCQ01831 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
XPCQ01831 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
XPCQ01831 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
XPCQ01831 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
XPCQ01831 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
XPCQ01831 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
XPCQ01831 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
XPCQ01831 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
XPCQ01831 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
XPCQ01831 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
XPCQ01831 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
XPCQ01831 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
XPCQ01831 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
XPCQ01831 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
XPCQ01831 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
XPCQ01831 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
XPCQ01831 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
XPCQ01831 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
XPCQ01831 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
XPCQ01831 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
XPCQ01831 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
XPCQ01831 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
XPCQ01831 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
XPCQ01831 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
XPCQ01831 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
XPCQ01831 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
XPCQ01831 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
XPCQ01831 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
XPCQ01831 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
XPCQ01831 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
XPCQ01831 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
XPCQ01831 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
XPCQ01831 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
XPCQ01831 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
XPCQ01831 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
XPCQ01831 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
XPCQ01831 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
XPCQ01831 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
XPCQ01831 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
XPCQ01831 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
XPCQ01831 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
XPCQ01831 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
XPCQ01831 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
XPCQ01831 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC20.77■□□□□ 0.91
XPCQ01831 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
XPCQ01831 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
XPCQ01831 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
XPCQ01831 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
XPCQ01831 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
XPCQ01831 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
XPCQ01831 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC20.77■□□□□ 0.91
XPCQ01831 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
XPCQ01831 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
XPCQ01831 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
XPCQ01831 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
XPCQ01831 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
XPCQ01831 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
XPCQ01831 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
XPCQ01831 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
XPCQ01831 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
XPCQ01831 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
XPCQ01831 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
XPCQ01831 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69 ms