Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms