Protein–RNA interactions for Protein: P81133

SIM1, Single-minded homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIM1P81133 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SIM1P81133 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SIM1P81133 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SIM1P81133 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SIM1P81133 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SIM1P81133 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SIM1P81133 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SIM1P81133 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SIM1P81133 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SIM1P81133 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SIM1P81133 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SIM1P81133 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SIM1P81133 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SIM1P81133 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SIM1P81133 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SIM1P81133 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SIM1P81133 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SIM1P81133 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SIM1P81133 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SIM1P81133 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SIM1P81133 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SIM1P81133 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SIM1P81133 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SIM1P81133 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SIM1P81133 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SIM1P81133 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SIM1P81133 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SIM1P81133 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SIM1P81133 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SIM1P81133 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SIM1P81133 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SIM1P81133 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SIM1P81133 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SIM1P81133 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SIM1P81133 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SIM1P81133 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SIM1P81133 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SIM1P81133 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SIM1P81133 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SIM1P81133 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SIM1P81133 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SIM1P81133 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SIM1P81133 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SIM1P81133 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SIM1P81133 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SIM1P81133 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SIM1P81133 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SIM1P81133 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SIM1P81133 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SIM1P81133 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SIM1P81133 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SIM1P81133 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SIM1P81133 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SIM1P81133 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SIM1P81133 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SIM1P81133 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SIM1P81133 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SIM1P81133 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SIM1P81133 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SIM1P81133 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SIM1P81133 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SIM1P81133 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SIM1P81133 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SIM1P81133 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SIM1P81133 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SIM1P81133 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SIM1P81133 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SIM1P81133 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SIM1P81133 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SIM1P81133 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SIM1P81133 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SIM1P81133 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SIM1P81133 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SIM1P81133 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SIM1P81133 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SIM1P81133 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SIM1P81133 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SIM1P81133 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SIM1P81133 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SIM1P81133 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SIM1P81133 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SIM1P81133 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SIM1P81133 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SIM1P81133 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SIM1P81133 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SIM1P81133 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SIM1P81133 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SIM1P81133 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SIM1P81133 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SIM1P81133 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SIM1P81133 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SIM1P81133 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SIM1P81133 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SIM1P81133 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SIM1P81133 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SIM1P81133 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SIM1P81133 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SIM1P81133 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SIM1P81133 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SIM1P81133 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms