Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms