Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ACTBP60709 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
ACTBP60709 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ACTBP60709 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ACTBP60709 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ACTBP60709 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
ACTBP60709 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
ACTBP60709 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ACTBP60709 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ACTBP60709 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ACTBP60709 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ACTBP60709 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ACTBP60709 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ACTBP60709 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ACTBP60709 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ACTBP60709 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
ACTBP60709 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
ACTBP60709 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
ACTBP60709 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ACTBP60709 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ACTBP60709 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ACTBP60709 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ACTBP60709 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ACTBP60709 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ACTBP60709 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ACTBP60709 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ACTBP60709 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ACTBP60709 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ACTBP60709 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ACTBP60709 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ACTBP60709 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ACTBP60709 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ACTBP60709 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ACTBP60709 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ACTBP60709 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ACTBP60709 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ACTBP60709 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ACTBP60709 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ACTBP60709 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
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ACTBP60709 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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ACTBP60709 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ACTBP60709 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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ACTBP60709 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ACTBP60709 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ACTBP60709 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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ACTBP60709 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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ACTBP60709 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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ACTBP60709 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ACTBP60709 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ACTBP60709 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ACTBP60709 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ACTBP60709 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ACTBP60709 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ACTBP60709 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ACTBP60709 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ACTBP60709 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ACTBP60709 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ACTBP60709 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
ACTBP60709 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ACTBP60709 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ACTBP60709 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ACTBP60709 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ACTBP60709 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ACTBP60709 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ACTBP60709 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ACTBP60709 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
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