Protein–RNA interactions for Protein: P54753

EPHB3, Ephrin type-B receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB3P54753 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms