Protein–RNA interactions for Protein: P54646

PRKAA2, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAA2P54646 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKAA2P54646 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKAA2P54646 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKAA2P54646 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKAA2P54646 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKAA2P54646 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKAA2P54646 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKAA2P54646 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKAA2P54646 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKAA2P54646 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKAA2P54646 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKAA2P54646 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKAA2P54646 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKAA2P54646 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKAA2P54646 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKAA2P54646 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKAA2P54646 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKAA2P54646 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKAA2P54646 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKAA2P54646 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKAA2P54646 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKAA2P54646 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKAA2P54646 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKAA2P54646 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKAA2P54646 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKAA2P54646 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKAA2P54646 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKAA2P54646 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKAA2P54646 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKAA2P54646 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKAA2P54646 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKAA2P54646 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKAA2P54646 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKAA2P54646 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKAA2P54646 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKAA2P54646 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKAA2P54646 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKAA2P54646 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKAA2P54646 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKAA2P54646 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKAA2P54646 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKAA2P54646 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKAA2P54646 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKAA2P54646 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKAA2P54646 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKAA2P54646 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKAA2P54646 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKAA2P54646 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKAA2P54646 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKAA2P54646 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKAA2P54646 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKAA2P54646 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKAA2P54646 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKAA2P54646 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKAA2P54646 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKAA2P54646 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKAA2P54646 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKAA2P54646 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKAA2P54646 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKAA2P54646 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKAA2P54646 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKAA2P54646 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKAA2P54646 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKAA2P54646 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKAA2P54646 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKAA2P54646 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKAA2P54646 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKAA2P54646 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKAA2P54646 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKAA2P54646 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKAA2P54646 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKAA2P54646 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKAA2P54646 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKAA2P54646 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKAA2P54646 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKAA2P54646 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKAA2P54646 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKAA2P54646 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKAA2P54646 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKAA2P54646 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKAA2P54646 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKAA2P54646 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKAA2P54646 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKAA2P54646 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKAA2P54646 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKAA2P54646 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKAA2P54646 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKAA2P54646 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKAA2P54646 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKAA2P54646 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKAA2P54646 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKAA2P54646 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKAA2P54646 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKAA2P54646 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKAA2P54646 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKAA2P54646 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKAA2P54646 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKAA2P54646 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKAA2P54646 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKAA2P54646 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.4 ms