Protein–RNA interactions for Protein: P54289

CACNA2D1, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D1P54289 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA2D1P54289 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA2D1P54289 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA2D1P54289 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA2D1P54289 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA2D1P54289 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA2D1P54289 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA2D1P54289 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA2D1P54289 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA2D1P54289 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA2D1P54289 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA2D1P54289 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA2D1P54289 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA2D1P54289 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA2D1P54289 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA2D1P54289 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA2D1P54289 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA2D1P54289 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA2D1P54289 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA2D1P54289 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA2D1P54289 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA2D1P54289 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA2D1P54289 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA2D1P54289 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA2D1P54289 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA2D1P54289 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA2D1P54289 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA2D1P54289 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA2D1P54289 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA2D1P54289 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA2D1P54289 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA2D1P54289 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA2D1P54289 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA2D1P54289 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA2D1P54289 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA2D1P54289 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA2D1P54289 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA2D1P54289 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA2D1P54289 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA2D1P54289 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA2D1P54289 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA2D1P54289 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA2D1P54289 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA2D1P54289 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA2D1P54289 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA2D1P54289 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA2D1P54289 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA2D1P54289 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA2D1P54289 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA2D1P54289 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA2D1P54289 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA2D1P54289 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA2D1P54289 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA2D1P54289 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA2D1P54289 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA2D1P54289 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA2D1P54289 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA2D1P54289 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA2D1P54289 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA2D1P54289 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA2D1P54289 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA2D1P54289 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA2D1P54289 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA2D1P54289 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA2D1P54289 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA2D1P54289 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA2D1P54289 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA2D1P54289 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA2D1P54289 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA2D1P54289 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA2D1P54289 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA2D1P54289 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA2D1P54289 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA2D1P54289 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA2D1P54289 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA2D1P54289 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA2D1P54289 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA2D1P54289 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA2D1P54289 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA2D1P54289 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA2D1P54289 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA2D1P54289 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA2D1P54289 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA2D1P54289 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA2D1P54289 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA2D1P54289 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA2D1P54289 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA2D1P54289 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA2D1P54289 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA2D1P54289 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA2D1P54289 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA2D1P54289 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA2D1P54289 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA2D1P54289 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA2D1P54289 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA2D1P54289 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA2D1P54289 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA2D1P54289 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA2D1P54289 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA2D1P54289 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms