Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SMARCA4P51532 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
SMARCA4P51532 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
SMARCA4P51532 CHCHD7-202ENST00000355315 1535 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
SMARCA4P51532 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SMARCA4P51532 IDS-203ENST00000428056 1213 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SMARCA4P51532 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SMARCA4P51532 CYB561D1-207ENST00000527072 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SMARCA4P51532 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SMARCA4P51532 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SMARCA4P51532 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SMARCA4P51532 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SMARCA4P51532 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SMARCA4P51532 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SMARCA4P51532 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SMARCA4P51532 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
SMARCA4P51532 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SMARCA4P51532 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SMARCA4P51532 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
SMARCA4P51532 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SMARCA4P51532 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SMARCA4P51532 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SMARCA4P51532 AC109460.1-201ENST00000567209 1478 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SMARCA4P51532 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SMARCA4P51532 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SMARCA4P51532 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SMARCA4P51532 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
SMARCA4P51532 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SMARCA4P51532 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SMARCA4P51532 AC096649.1-201ENST00000449168 497 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SMARCA4P51532 ZAP70-202ENST00000451498 1085 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SMARCA4P51532 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SMARCA4P51532 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SMARCA4P51532 NUDT4P2-201ENST00000578341 546 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
SMARCA4P51532 ZNF586-204ENST00000598183 603 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SMARCA4P51532 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
SMARCA4P51532 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SMARCA4P51532 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SMARCA4P51532 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SMARCA4P51532 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SMARCA4P51532 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SMARCA4P51532 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SMARCA4P51532 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SMARCA4P51532 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SMARCA4P51532 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SMARCA4P51532 RELL1-201ENST00000314117 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SMARCA4P51532 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SMARCA4P51532 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SMARCA4P51532 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SMARCA4P51532 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SMARCA4P51532 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SMARCA4P51532 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SMARCA4P51532 MAGOH-202ENST00000371470 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SMARCA4P51532 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SMARCA4P51532 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SMARCA4P51532 MIR503HG-202ENST00000440570 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SMARCA4P51532 TNNT2-214ENST00000458432 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SMARCA4P51532 AC003982.2-201ENST00000536933 365 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SMARCA4P51532 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SMARCA4P51532 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SMARCA4P51532 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SMARCA4P51532 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SMARCA4P51532 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
SMARCA4P51532 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SMARCA4P51532 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SMARCA4P51532 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SMARCA4P51532 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SMARCA4P51532 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SMARCA4P51532 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SMARCA4P51532 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SMARCA4P51532 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SMARCA4P51532 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SMARCA4P51532 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SMARCA4P51532 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SMARCA4P51532 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SMARCA4P51532 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
SMARCA4P51532 AC005392.1-201ENST00000419624 500 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SMARCA4P51532 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SMARCA4P51532 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SMARCA4P51532 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SMARCA4P51532 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SMARCA4P51532 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SMARCA4P51532 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SMARCA4P51532 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SMARCA4P51532 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
SMARCA4P51532 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SMARCA4P51532 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SMARCA4P51532 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SMARCA4P51532 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SMARCA4P51532 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SMARCA4P51532 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SMARCA4P51532 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SMARCA4P51532 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SMARCA4P51532 LINC01868-201ENST00000414965 562 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SMARCA4P51532 AC092265.1-201ENST00000422638 498 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SMARCA4P51532 ZNF124-206ENST00000543802 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SMARCA4P51532 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
SMARCA4P51532 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SMARCA4P51532 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SMARCA4P51532 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms