Protein–RNA interactions for Protein: P50238

CRIP1, Cysteine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP1P50238 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC11.49□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC11.49□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms