Protein–RNA interactions for Protein: P49354

FNTA, Protein farnesyltransferase/geranylgeranyltransferase type-1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTAP49354 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FNTAP49354 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
FNTAP49354 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FNTAP49354 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FNTAP49354 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FNTAP49354 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FNTAP49354 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FNTAP49354 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FNTAP49354 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FNTAP49354 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FNTAP49354 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FNTAP49354 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FNTAP49354 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FNTAP49354 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FNTAP49354 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FNTAP49354 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FNTAP49354 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FNTAP49354 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FNTAP49354 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FNTAP49354 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FNTAP49354 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FNTAP49354 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FNTAP49354 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FNTAP49354 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FNTAP49354 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FNTAP49354 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FNTAP49354 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FNTAP49354 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FNTAP49354 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
FNTAP49354 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FNTAP49354 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
FNTAP49354 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
FNTAP49354 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
FNTAP49354 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
FNTAP49354 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FNTAP49354 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
FNTAP49354 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FNTAP49354 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FNTAP49354 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FNTAP49354 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FNTAP49354 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FNTAP49354 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FNTAP49354 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FNTAP49354 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FNTAP49354 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FNTAP49354 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FNTAP49354 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
FNTAP49354 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FNTAP49354 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FNTAP49354 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
FNTAP49354 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FNTAP49354 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
FNTAP49354 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FNTAP49354 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FNTAP49354 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FNTAP49354 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FNTAP49354 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FNTAP49354 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FNTAP49354 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FNTAP49354 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FNTAP49354 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FNTAP49354 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FNTAP49354 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FNTAP49354 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FNTAP49354 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FNTAP49354 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FNTAP49354 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FNTAP49354 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FNTAP49354 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FNTAP49354 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
FNTAP49354 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FNTAP49354 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FNTAP49354 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
FNTAP49354 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FNTAP49354 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FNTAP49354 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FNTAP49354 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FNTAP49354 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FNTAP49354 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FNTAP49354 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FNTAP49354 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FNTAP49354 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FNTAP49354 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FNTAP49354 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FNTAP49354 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
FNTAP49354 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FNTAP49354 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FNTAP49354 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FNTAP49354 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FNTAP49354 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FNTAP49354 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FNTAP49354 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
FNTAP49354 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FNTAP49354 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FNTAP49354 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
FNTAP49354 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FNTAP49354 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FNTAP49354 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FNTAP49354 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FNTAP49354 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms