Protein–RNA interactions for Protein: P46926

GNPDA1, Glucosamine-6-phosphate isomerase 1, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPDA1P46926 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms