Protein–RNA interactions for Protein: P43121

MCAM, Cell surface glycoprotein MUC18, humanhuman

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Length 646 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCAMP43121 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MCAMP43121 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MCAMP43121 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MCAMP43121 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
MCAMP43121 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MCAMP43121 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MCAMP43121 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MCAMP43121 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
MCAMP43121 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MCAMP43121 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MCAMP43121 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MCAMP43121 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MCAMP43121 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
MCAMP43121 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MCAMP43121 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MCAMP43121 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MCAMP43121 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MCAMP43121 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MCAMP43121 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MCAMP43121 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MCAMP43121 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MCAMP43121 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MCAMP43121 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MCAMP43121 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
MCAMP43121 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MCAMP43121 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MCAMP43121 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MCAMP43121 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MCAMP43121 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MCAMP43121 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MCAMP43121 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MCAMP43121 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MCAMP43121 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MCAMP43121 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
MCAMP43121 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MCAMP43121 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MCAMP43121 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MCAMP43121 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MCAMP43121 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MCAMP43121 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MCAMP43121 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
MCAMP43121 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
MCAMP43121 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MCAMP43121 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
MCAMP43121 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MCAMP43121 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MCAMP43121 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MCAMP43121 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MCAMP43121 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MCAMP43121 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MCAMP43121 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MCAMP43121 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MCAMP43121 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MCAMP43121 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MCAMP43121 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MCAMP43121 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
MCAMP43121 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MCAMP43121 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MCAMP43121 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MCAMP43121 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MCAMP43121 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
MCAMP43121 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MCAMP43121 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MCAMP43121 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MCAMP43121 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
MCAMP43121 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MCAMP43121 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MCAMP43121 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MCAMP43121 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MCAMP43121 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MCAMP43121 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MCAMP43121 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MCAMP43121 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MCAMP43121 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MCAMP43121 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MCAMP43121 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MCAMP43121 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MCAMP43121 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MCAMP43121 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MCAMP43121 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MCAMP43121 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MCAMP43121 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MCAMP43121 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MCAMP43121 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MCAMP43121 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MCAMP43121 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MCAMP43121 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MCAMP43121 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MCAMP43121 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MCAMP43121 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MCAMP43121 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
MCAMP43121 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MCAMP43121 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MCAMP43121 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MCAMP43121 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MCAMP43121 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
MCAMP43121 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MCAMP43121 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MCAMP43121 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MCAMP43121 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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