Protein–RNA interactions for Protein: P35212

GJA4, Gap junction alpha-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA4P35212 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GJA4P35212 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GJA4P35212 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GJA4P35212 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GJA4P35212 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GJA4P35212 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GJA4P35212 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GJA4P35212 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GJA4P35212 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GJA4P35212 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GJA4P35212 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GJA4P35212 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GJA4P35212 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GJA4P35212 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GJA4P35212 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GJA4P35212 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GJA4P35212 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GJA4P35212 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GJA4P35212 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GJA4P35212 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GJA4P35212 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GJA4P35212 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GJA4P35212 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GJA4P35212 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GJA4P35212 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GJA4P35212 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GJA4P35212 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GJA4P35212 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GJA4P35212 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GJA4P35212 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GJA4P35212 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GJA4P35212 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GJA4P35212 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GJA4P35212 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GJA4P35212 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GJA4P35212 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GJA4P35212 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GJA4P35212 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GJA4P35212 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GJA4P35212 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GJA4P35212 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GJA4P35212 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GJA4P35212 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GJA4P35212 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GJA4P35212 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GJA4P35212 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GJA4P35212 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GJA4P35212 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GJA4P35212 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GJA4P35212 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GJA4P35212 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GJA4P35212 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GJA4P35212 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GJA4P35212 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GJA4P35212 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GJA4P35212 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GJA4P35212 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GJA4P35212 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GJA4P35212 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GJA4P35212 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GJA4P35212 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GJA4P35212 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GJA4P35212 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GJA4P35212 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GJA4P35212 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GJA4P35212 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GJA4P35212 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GJA4P35212 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GJA4P35212 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GJA4P35212 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GJA4P35212 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GJA4P35212 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GJA4P35212 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GJA4P35212 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GJA4P35212 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GJA4P35212 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GJA4P35212 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GJA4P35212 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GJA4P35212 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GJA4P35212 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GJA4P35212 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GJA4P35212 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GJA4P35212 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GJA4P35212 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GJA4P35212 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GJA4P35212 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GJA4P35212 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GJA4P35212 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GJA4P35212 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GJA4P35212 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GJA4P35212 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GJA4P35212 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GJA4P35212 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GJA4P35212 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GJA4P35212 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GJA4P35212 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GJA4P35212 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GJA4P35212 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GJA4P35212 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GJA4P35212 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms