Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms