Protein–RNA interactions for Protein: P30038

ALDH4A1, Delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH4A1P30038 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ALDH4A1P30038 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ALDH4A1P30038 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ALDH4A1P30038 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ALDH4A1P30038 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ALDH4A1P30038 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ALDH4A1P30038 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ALDH4A1P30038 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ALDH4A1P30038 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ALDH4A1P30038 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ALDH4A1P30038 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ALDH4A1P30038 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ALDH4A1P30038 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ALDH4A1P30038 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ALDH4A1P30038 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ALDH4A1P30038 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ALDH4A1P30038 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ALDH4A1P30038 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ALDH4A1P30038 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ALDH4A1P30038 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ALDH4A1P30038 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ALDH4A1P30038 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ALDH4A1P30038 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ALDH4A1P30038 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ALDH4A1P30038 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ALDH4A1P30038 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ALDH4A1P30038 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ALDH4A1P30038 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ALDH4A1P30038 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ALDH4A1P30038 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ALDH4A1P30038 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ALDH4A1P30038 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ALDH4A1P30038 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ALDH4A1P30038 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ALDH4A1P30038 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ALDH4A1P30038 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ALDH4A1P30038 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ALDH4A1P30038 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ALDH4A1P30038 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ALDH4A1P30038 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ALDH4A1P30038 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ALDH4A1P30038 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ALDH4A1P30038 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ALDH4A1P30038 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ALDH4A1P30038 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ALDH4A1P30038 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ALDH4A1P30038 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ALDH4A1P30038 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ALDH4A1P30038 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ALDH4A1P30038 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ALDH4A1P30038 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ALDH4A1P30038 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ALDH4A1P30038 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ALDH4A1P30038 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ALDH4A1P30038 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ALDH4A1P30038 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ALDH4A1P30038 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ALDH4A1P30038 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ALDH4A1P30038 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ALDH4A1P30038 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ALDH4A1P30038 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ALDH4A1P30038 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ALDH4A1P30038 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ALDH4A1P30038 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ALDH4A1P30038 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ALDH4A1P30038 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ALDH4A1P30038 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ALDH4A1P30038 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ALDH4A1P30038 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ALDH4A1P30038 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ALDH4A1P30038 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ALDH4A1P30038 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ALDH4A1P30038 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ALDH4A1P30038 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ALDH4A1P30038 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ALDH4A1P30038 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ALDH4A1P30038 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ALDH4A1P30038 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ALDH4A1P30038 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ALDH4A1P30038 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ALDH4A1P30038 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ALDH4A1P30038 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ALDH4A1P30038 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ALDH4A1P30038 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ALDH4A1P30038 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ALDH4A1P30038 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ALDH4A1P30038 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ALDH4A1P30038 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ALDH4A1P30038 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ALDH4A1P30038 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ALDH4A1P30038 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ALDH4A1P30038 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ALDH4A1P30038 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ALDH4A1P30038 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ALDH4A1P30038 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ALDH4A1P30038 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ALDH4A1P30038 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ALDH4A1P30038 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ALDH4A1P30038 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ALDH4A1P30038 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms