Protein–RNA interactions for Protein: P29508

SERPINB3, Serpin B3, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINB3P29508 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SERPINB3P29508 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SERPINB3P29508 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SERPINB3P29508 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SERPINB3P29508 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SERPINB3P29508 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SERPINB3P29508 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SERPINB3P29508 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SERPINB3P29508 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SERPINB3P29508 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SERPINB3P29508 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SERPINB3P29508 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SERPINB3P29508 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SERPINB3P29508 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SERPINB3P29508 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SERPINB3P29508 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SERPINB3P29508 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SERPINB3P29508 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SERPINB3P29508 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SERPINB3P29508 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SERPINB3P29508 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SERPINB3P29508 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SERPINB3P29508 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SERPINB3P29508 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SERPINB3P29508 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SERPINB3P29508 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SERPINB3P29508 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SERPINB3P29508 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SERPINB3P29508 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SERPINB3P29508 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERPINB3P29508 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERPINB3P29508 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERPINB3P29508 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SERPINB3P29508 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERPINB3P29508 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERPINB3P29508 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERPINB3P29508 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERPINB3P29508 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERPINB3P29508 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERPINB3P29508 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERPINB3P29508 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERPINB3P29508 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERPINB3P29508 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERPINB3P29508 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERPINB3P29508 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERPINB3P29508 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERPINB3P29508 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERPINB3P29508 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERPINB3P29508 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERPINB3P29508 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERPINB3P29508 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERPINB3P29508 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERPINB3P29508 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERPINB3P29508 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERPINB3P29508 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERPINB3P29508 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERPINB3P29508 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERPINB3P29508 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERPINB3P29508 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERPINB3P29508 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SERPINB3P29508 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERPINB3P29508 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERPINB3P29508 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SERPINB3P29508 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SERPINB3P29508 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERPINB3P29508 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERPINB3P29508 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERPINB3P29508 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERPINB3P29508 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERPINB3P29508 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERPINB3P29508 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERPINB3P29508 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERPINB3P29508 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERPINB3P29508 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERPINB3P29508 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERPINB3P29508 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERPINB3P29508 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERPINB3P29508 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERPINB3P29508 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERPINB3P29508 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERPINB3P29508 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERPINB3P29508 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERPINB3P29508 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERPINB3P29508 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERPINB3P29508 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERPINB3P29508 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERPINB3P29508 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERPINB3P29508 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERPINB3P29508 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERPINB3P29508 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERPINB3P29508 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERPINB3P29508 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERPINB3P29508 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERPINB3P29508 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERPINB3P29508 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERPINB3P29508 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERPINB3P29508 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SERPINB3P29508 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERPINB3P29508 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERPINB3P29508 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms