Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRGP23470 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRGP23470 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRGP23470 TMEM242-201ENST00000367144 1030 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRGP23470 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRGP23470 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRGP23470 LINC01868-201ENST00000414965 562 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRGP23470 AC005392.1-201ENST00000419624 500 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRGP23470 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRGP23470 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRGP23470 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRGP23470 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRGP23470 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRGP23470 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRGP23470 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRGP23470 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRGP23470 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRGP23470 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRGP23470 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRGP23470 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRGP23470 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRGP23470 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRGP23470 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRGP23470 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRGP23470 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRGP23470 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRGP23470 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRGP23470 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRGP23470 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRGP23470 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRGP23470 AL020996.1-201ENST00000442055 435 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRGP23470 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRGP23470 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRGP23470 ORAOV1P1-201ENST00000503108 395 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRGP23470 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRGP23470 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRGP23470 DNM1P51-201ENST00000558149 522 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRGP23470 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRGP23470 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRGP23470 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRGP23470 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRGP23470 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRGP23470 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRGP23470 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRGP23470 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRGP23470 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRGP23470 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRGP23470 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRGP23470 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRGP23470 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRGP23470 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRGP23470 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRGP23470 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRGP23470 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRGP23470 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRGP23470 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRGP23470 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRGP23470 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRGP23470 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRGP23470 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRGP23470 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRGP23470 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRGP23470 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRGP23470 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRGP23470 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRGP23470 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRGP23470 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRGP23470 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRGP23470 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRGP23470 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRGP23470 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRGP23470 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRGP23470 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRGP23470 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRGP23470 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRGP23470 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRGP23470 CNRIP1-202ENST00000409559 644 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRGP23470 IFI35-203ENST00000415816 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRGP23470 FAU-202ENST00000434372 533 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRGP23470 AL157788.1-201ENST00000437838 229 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRGP23470 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRGP23470 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRGP23470 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRGP23470 DNAJB13-203ENST00000537753 912 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRGP23470 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRGP23470 AC068025.1-201ENST00000577218 762 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRGP23470 AC005041.3-201ENST00000606287 649 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRGP23470 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRGP23470 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRGP23470 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRGP23470 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRGP23470 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRGP23470 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRGP23470 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRGP23470 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRGP23470 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRGP23470 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRGP23470 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRGP23470 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRGP23470 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
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