Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
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