Protein–RNA interactions for Protein: P21695

GPD1, Glycerol-3-phosphate dehydrogenase [NAD(+)], cytoplasmic, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPD1P21695 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GPD1P21695 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
GPD1P21695 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
GPD1P21695 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
GPD1P21695 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GPD1P21695 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GPD1P21695 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GPD1P21695 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GPD1P21695 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GPD1P21695 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GPD1P21695 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GPD1P21695 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GPD1P21695 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GPD1P21695 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GPD1P21695 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GPD1P21695 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GPD1P21695 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GPD1P21695 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GPD1P21695 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GPD1P21695 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GPD1P21695 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GPD1P21695 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GPD1P21695 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GPD1P21695 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GPD1P21695 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GPD1P21695 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GPD1P21695 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GPD1P21695 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GPD1P21695 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GPD1P21695 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GPD1P21695 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GPD1P21695 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GPD1P21695 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GPD1P21695 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GPD1P21695 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GPD1P21695 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GPD1P21695 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GPD1P21695 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GPD1P21695 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GPD1P21695 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GPD1P21695 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GPD1P21695 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GPD1P21695 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GPD1P21695 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GPD1P21695 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GPD1P21695 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GPD1P21695 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GPD1P21695 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GPD1P21695 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GPD1P21695 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GPD1P21695 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPD1P21695 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPD1P21695 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPD1P21695 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPD1P21695 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPD1P21695 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GPD1P21695 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPD1P21695 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPD1P21695 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPD1P21695 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPD1P21695 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPD1P21695 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPD1P21695 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPD1P21695 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPD1P21695 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPD1P21695 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPD1P21695 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPD1P21695 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPD1P21695 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPD1P21695 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPD1P21695 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPD1P21695 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPD1P21695 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPD1P21695 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GPD1P21695 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPD1P21695 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPD1P21695 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPD1P21695 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPD1P21695 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPD1P21695 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPD1P21695 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPD1P21695 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPD1P21695 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPD1P21695 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPD1P21695 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPD1P21695 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPD1P21695 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPD1P21695 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPD1P21695 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPD1P21695 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPD1P21695 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPD1P21695 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPD1P21695 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPD1P21695 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPD1P21695 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPD1P21695 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPD1P21695 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPD1P21695 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPD1P21695 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPD1P21695 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms