Protein–RNA interactions for Protein: P15056

BRAF, Serine/threonine-protein kinase B-raf, humanhuman

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Length 766 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRAFP15056 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BRAFP15056 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BRAFP15056 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BRAFP15056 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
BRAFP15056 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BRAFP15056 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BRAFP15056 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BRAFP15056 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BRAFP15056 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BRAFP15056 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BRAFP15056 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BRAFP15056 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BRAFP15056 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BRAFP15056 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BRAFP15056 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BRAFP15056 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BRAFP15056 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BRAFP15056 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BRAFP15056 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BRAFP15056 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
BRAFP15056 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BRAFP15056 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BRAFP15056 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
BRAFP15056 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BRAFP15056 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BRAFP15056 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BRAFP15056 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BRAFP15056 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BRAFP15056 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BRAFP15056 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BRAFP15056 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BRAFP15056 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BRAFP15056 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BRAFP15056 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BRAFP15056 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
BRAFP15056 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
BRAFP15056 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
BRAFP15056 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
BRAFP15056 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
BRAFP15056 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
BRAFP15056 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
BRAFP15056 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
BRAFP15056 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BRAFP15056 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BRAFP15056 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BRAFP15056 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BRAFP15056 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BRAFP15056 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BRAFP15056 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BRAFP15056 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BRAFP15056 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BRAFP15056 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BRAFP15056 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BRAFP15056 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BRAFP15056 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BRAFP15056 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BRAFP15056 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BRAFP15056 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BRAFP15056 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BRAFP15056 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BRAFP15056 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BRAFP15056 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BRAFP15056 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BRAFP15056 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BRAFP15056 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
BRAFP15056 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BRAFP15056 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BRAFP15056 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BRAFP15056 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BRAFP15056 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BRAFP15056 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BRAFP15056 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BRAFP15056 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BRAFP15056 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BRAFP15056 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BRAFP15056 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BRAFP15056 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BRAFP15056 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BRAFP15056 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BRAFP15056 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BRAFP15056 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BRAFP15056 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BRAFP15056 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BRAFP15056 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
BRAFP15056 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BRAFP15056 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BRAFP15056 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BRAFP15056 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BRAFP15056 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BRAFP15056 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BRAFP15056 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BRAFP15056 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BRAFP15056 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BRAFP15056 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BRAFP15056 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BRAFP15056 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BRAFP15056 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BRAFP15056 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BRAFP15056 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BRAFP15056 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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